Итак.

• 1. Первым шагом отключаем синхронизацию сохранений для игры.
  В моём англ. steam это называется " Steam Cloud synchronization"
  
• 2. Создаём две новые компании и сохраняем их в самом старте (когда впервые одеваем костюм, висящий на двери).
  
• 3. Качаем сохранения с этого мануала Achievements: I And It, Awkward Ride Home, No Needles (Save Files)
  Нужен архив Prey-IAndIt.zip
  В нём нам нужна папка manual1
  Полый путь "Prey-IAndIt (1).zip/Compaign0/manual1"
  
  Или вы можете использовать ваши собственные сохранения, если проходили без способностей.
  Это обязательно должно быть:
  
  • 1. Сохранение в самом конце игры
    
  • 2. Без способностей тифонов или людей
    
  • 3. В сумке должны быть нейромоды
• 4. Всё, у нас есть сохранеие в конце игры, без способностей и с нейромодами.
  Помещаем его в каждую компанию, которую создали на шаге 2.
  Путь к сохранениям игры:
  C:\Users\<Your Profile or Name>\Saved Games\Arkane Studios\Prey\SaveGames\
  Ещё раз.
  На шаге 2 вы создали две компании.
  Это папки Compaign0 и Compaign1 в папке SaveGames
  Помещаем в каждую компанию папку manual1
  
• 5. Загружаем каждую компанию, изучаем способности, проходим игру.
  Когда пройдём оба сохранения, первое за людей, второй за тифонов или наоборот, то получим ачивку.

По пути
C:\Users\<Your Profile or Name>\Saved Games\Arkane Studios\Prey\Profiles\default\attributes.xml

Когда вы заканчиваете игру, используя, например, только способности людей, то в файле генерируется строка
<Attr name="SplitAffinityHumanCampaign" value="13594806764684438126"/>

Это большое число - GUID компании. Поэтому,если вы загрузите сохранение и пройдёте за Тифонов, то не получите ачивку. Потому, что игра тупо поменяет эту строку на
<Attr name="SplitAffinityAlienCampaign" value="13594806764684438126"/>

Нужны именно две разные компании!

Спасибо пользователю Lek за обнаружение механизма attributes.xml