Назовите свой корабль следующим именем и получите 10 драгоценных камней и достижение:

Discovery
Galactica
Ghost Ship
Grampus
Heart of Gold
Hispaniola
Nautilus
Nostromo
Pequod
Red Five
USS Enterprise
U-96
Basin City
BonanzaCreek
Gotham
Innsmouth

Установите соответствующую дату на компьютер чтобы получить 10 драгоценных камней, достижение и титул:
14 апреля - титул "Anno 1404 fan"
15 марта - титул "1503 A.D. fan"
16 февраля - титул "1602 A.D. fan"
17 января - титул "1701 A.D. fan"

Специальные достижения:
Начните игру между 3:00 и 5:00 утра и получите 10 драгоценных камней и достижение
Начните игру 11 ноября в 11:11 утра и получите 10 драгоценных камней и достижение

Также вы можете получить достижение за:
Постройку 1000 крестьянских домов за игру
24 часа беспрерывной игры
снятие 500 скриншотов
2 часа игры при максимальном приближении
10 часов игры при среднем приближении
20 часов игры на максимальном удалении камеры
250 раз нажать паузу
уничтожить 2500 вражеских кораблей
ускорить игру в течении часа

Шуточное достижение:

Назовите свой город "BonanzaCreek" и вы получите сообщение что в игре нет читов, титу "Cheater", достижение "Cheater" и 10 драгоценных камней.

Для лицензионной русской версии

Назовите свой корабль следующим именем и получите 10 драгоценных камней и достижение:

Discovery - Discovery
Galactica - Roger Young
Ghost Ship - Корабль призраков (баг локализации не вмещается название - решение поставить английскую версию игры ввести Ghost Ship и получить достижение потом поменять на русскую версию)
Grampus - Grampus
Heart of Gold - Золотое сердце
Hispaniola - Испаньола
Nautilus - Наутилус
Nostromo - Nostromo
Pequod - Моби-Дик
Red Five - Rot Fuenf
USS Enterprise - USS Enterprise
U-96 - U-96
Город:
Basin City - Бэйсин-сити
BonanzaCreek - Ручей Бонанза
Gotham - Готэм
Innsmouth - Инсмут

Назовите свой город "Ручей Бонанза" и вы получите сообщение что в игре нет читов, титул "Cheater", достижение "Cheater" и 10 драгоценных камней

Если в главном меню нажать на логотип игры сверху, то пойдут титры, в которых можно послушать забавные комментарии персонажей игры.

В первой миссии в кампании на острове Лорда Нортберга при помощи редактирования маршрута (F6) можно увидеть зелёное сердце.

Если запустить игру на Пасху, вам будет выдано забавное задание: найти все пасхальные яйца, спрятанные в городе. Отыскать их несложно: они все лежат в гнездах, которые заботливо разложены разработчиками на дорогах. На выполнение задания выдается пять с половиной минут, так что спешите! В награду начисляется 500 очков славы.

К слову, вовсе необязательно ждать целый год, чтобы увидеть эту пасхалку. Просто поставьте в системных настройках нужную дату (например, 04.04.2010) и запускайте игру.