Karakterler

• Carl'ın(CJ) duruşu Tommy'nin duruşuna benziyordu.
• Officer Carver, Larry ve Poncho adlı karakterler oyundan silindi. Üçü de çeşitli karakollarda çalışıyordu.
• Sweet ve Big Smoke'un görünümleri değiştirildi. Sweet siyah giyiyordu. Big Smoke ise beyaz kazak giyiyordu, şapkası yoktu ve keldi.(Smoke'un bu hali onun uyuşturucu fabrikasında görülebilir.)
• Kendl Johnson'ın(CJ'in kız kardeşi), yüzü ve giysileri değiştirildi.
• Çete üyeleri farklı görünüyor ve farklı giyiniyordu. (Los Sepulcros görevinde görülebilir.)
• Her şehirde değişik motorlu polisler vardı. Ancak final sürümünde hepsinin tipi aynı. Farklı tipler oyunun dosyalarında bulunuyor.
• Strateji rehberine göre Triad üyeleri değişikti.
• Vice City'deki Steve Scott, San Andreas'a büyük bir aksiyon filmi için gidiyordu.
• CJ, eskiden daha büyük görünüyordu.
• Oyunun dosyalarında kullanılmayan yayalar var ve bazıları taksi şöforü tipinde. Ayrıca bir tane kadın uşak da var. Bunlar büyük ihtimalle oyundan silindi.

Görevler

• The Truth is Out There ve Impounded isimli görevler silindi ya da Doberman, Photo Opportunity ve Beat Down on B Dup görevlerine aktarıldı.
• İlk sürümde CJ ile Marco Forelli'nin Portland'ın tamamında bir kovalamacası vardı. Ancak oyunun final sürümünde sadece Marcos Bistro, Red Light District, Chinotown'un ve Portland Wiev'in belirli bölümleri kaldı.
• Fish in a Barrel görevi, söylentilere göre önceden sadece oyun içi bir bölümden ibaretti ve sonradan görev haline getirildi.
• Sweet Girl's görevinde Sweet'in silahı yoktu ve CJ onu koruyordu.
• Photo Opportunity görevindeki kullanılmayan bir metne göre CJ kaçırıldı ve helikopter kullandı.
• Oyunda search for Big Smoke adlı bir görev olacaktı.
• Los Santos Stadium'daki yarışlar değişik olacaktı.
• Duvarlarda San Fierro Rifa çetelerine ait yazılar vardı. Oyunun dosyalarında mevcut.

Oynanış

• CJ bir yaya öldürdüğünde haber ekibi gelecek ve yayın yapacaktı.
• CJ bir sokak direğine çarptığında hemen sokak direğini tamir etmek için işçiler gelecekti ve CJ onları öldürüp bölgeyi terketse bile bir süre için direk kırık kalacaktı.
• Haritada, alınması için 300'den fazla çete bölgesi bulunmaktaydı.
• GTA IV'teki gibi araba yıkanabiliyordu ancak bu özellik kaldırıldı.
• San Fierro'da tramvaylara binilebiliyordu, bu özellik kaldırıldı.
• CJ içki içtiğinde kamera sallanacaktı ve kontoller zorlaşacaktı.(GTA IV'te olduğu gibi.)
• Bira içebilme özelliği final sürümünde kaldırıldı.
• Bir dergide araba çalmanın daha zor olduğu, arabanın bazen düz kontak yapılarak çalıştırabildiği söyleniyor. Bu özellik PS2'nin yaptığı sınırlamalar yüzünden kaldırılmış. (Özellik, GTA IV'te mevcut.)
• Söylenenlere göre arabayı çarpınca arabadan tuhaf sesler geliyormuş.(GTA IV’teki gibi olsa gerek.) Bu ses oyunun beta videosunda veya bazı trailerlarda fark edilebilir.

Silahlar
• Kaykay oyundan silindi Paraşüt daha küçüktü ve maviydi. Uçuş okulundaki paraşüt kullanma videosunda paraşütün bu hali görülebilir.
• Micro-SMG oyundan silindi. Eski ekran görüntülerinde görülebilir.
• Paraşütün simgesi biraz farklıydı.
• AK-47'nin simgesi farklıydı.
• Jetpack ve cep telefonunun tıpkı diğer silahlar gibi simgesi vardı.
• Kürek, High Noon görevindeki gibi ahşap ve daha kısa olacaktı.

Yayalar

• Grove Street Families'in adı The Orange Grove Families olacaktı.
• The Ballas çetesinin adı The Flats olacaktı.
• Hayat kadınlarının örgülü ve kısa saçları vardı.
• Yayalar bar, club gibi yerlere girip çıkabilecekti. Ayrıca Grove Street Families üyeleri evimize girebilecekti.

Şehir

• Mullholland'daki evin içi, dışarıdan görünebiliyordu.
• San Fierro beta sürümünde daha detaylıydı ve daha fazla liman alanı ve park alanı vardı. Sürüş okulu da görülebilir.
• Downtown Los Santos'taki hastanenin yakınındaki inşaatta bir vinç vardı.
• Easter Basin Naval Station'da farklı çıkış yolları vardı. Liman vardı ve gemi yoktu.
• San Andreas farklıydı ve daha büyüktü. Daha fazla park alanı ve liman vardı. San Andreas'ın bu hali Lil' Probe'Inn'in duvarında görülebilir..

• Las Venturas'ın kısaltmasındaki baş harfler LG idi ve Las Venturas polis arabalarında LG yazıyordu. Büyük ihtimalle şehrin ismi farklıydı.
• Santa Flora'daki hastanenin çatısında iki tane helikopter alanı vardı. Burada Maverick ve Raindance vardı.
• The Clown's Pocket gazinosunun gerçek adı The Ringmaster'dı. Gerçek adıyla oyunun kutusunda yer alan haritada görülebilir.
• İkinci beta sürümünde Las Venturas'ın adı (LG olduktan sonra) Las Venturra'ydı.
• Beta sürümünde Bayside yoktu.
• Beta sürümünde Dillimore daha küçüktü.
• Beta sürümünde Hunter Quarry daha küçüktü.
• Red County'deki bazı yollar betada vardı ancak final sürümünde yok.
• Beta haritasına göre San Fierro'nun körfezinde Alcatraz adında küçük bir ada bulunuyordu.

Diğer

• Bilardo masaları mavi değil yeşildi.
• Adrenalin haplarının beta sürümünde olduğu söyleniyor. Bu özellik oyunda yok ancak hile ile aktif edilebilir. Oyunun dosyalarında hap modeli de mevcut.
• Bilardo masasının Madd Dogg'un evinde olduğu söyleniyor.
• Oyunun 2 DVD olması düşünülüyordu ancak final sürümü tek DVD haline getirildi. (Bu da San Andreas'ın önceden ne kadar büyük olduğunun göstergesi.)
• american.gxt dosyasına göre çok sayıda telefon görüşmesi kesilmiş.
• Oyunun dosyalarına göre oyundaki mağazalarda daha fazla tişört, pantolon vb. vardı.
• Oyundaki yük trenlerine araba konulabiliyordu. Bu özellik mod ile aktif edilebilir.