windows のレジストリーを編集する必要があるので、自己責任でやってください。

0. まずはゲームを１回起動します。起動してすぐ終了してもかまいません。
1. regedit を起動
2. \HKEY_CURRENT_USER\Software\KoeiTecmo\35th\San10WPK\Configs へ移動
　（もしゲームを起動していなかったらこれが作られていないはずなので起動しましょ）
3. 新規で以下の「DWORD値」を作る


これでウィンドウモードになるはず

this use registry editor so do this at your own risk.

0. first, you execute 「San10WPK.exe」once.
you just click execute button in steam.

1. press windows key + R and type "regedit.exe" and execute it.
2. search [\HKEY_CURRENT_USER\Software\KoeiTecmo\35th\San10WPK\Configs]
3. make new DWORD variable


now you can see running in windowed mode.

regedit.exe

run windowed mode

動作しないという報告を受けたので久しぶりに起動してみましたが、普通に動作します。
私がこれを書いた時はwindows 7 / 10 両方で動いてました。
いま当時とは別のPCで、Windows 11 上でも普通に動作します
動画が再生されないなどの問題もまったくなく普通に動いてます

もしやと思ってしばらくプレイもしてみましたが、動作に異常はありません

ウィンドウモードで動作するスクショを加工なしで添付するのでご参考ください。
動作しない方はなにかしら間違ったやり方をやっていませんか？
（レジストリのパスが正しくないか、あるいは値を０ではなく１とかに設定してるなど）
申し訳ないが、あなたの環境固有の問題であると思われます