自分も今同じ症状に悩んでます。
起動する際にキーボードの接続を外してから起動すると
コントローラーで操作できましたが、そのあと、キーボードをつなげると
左上に勝手に入力されるみたいです

今更ですが、自分も同じ症状になりましたが、解決できましたので共有します。
※まず大前提にゲーム起動前に全てのコントローラー接続を切ってください。
デバイスマネージャーを開き、上の表示→デバイス（コンテナー別）を押します。
次に自分が使用しているキーボードを展開し、HID準拠ゲームコントローラーを右クリックしデバイスを無効としたところ直りました。

これでも治らなかった場合、ライブラリでゲームのページへ行き、右側の歯車マークを押しプロパティを押します。
押した後左側のコントローラーを選び、右側のsteam入力を無効にするにしてみてください。
これで多分直るはずです。

同じ症状が発生しております。キーボードの接続を切っても発生するので手づまりです。
また、デバイスマネージャからHID準拠～から始まる諸々を調査的に無効にすると、Windowsの起動時にブルスクがループして止まらなくなることもあるので要注意です。